Leerdoelen
De competenties, gekoppeld aan de Bachelorproef, zijn het kunnen
plannen en uitvoeren van het manipulatie-gedeelte van onderzoek
(ECB8) , het kunnen begrijpen en beoordelen van onderzoeksresultaten
(ECB7), het in staat zijn een biologische vraagstelling te
formuleren (ECB6), het overbrengen van datgene wat de student
ontwikkelt
en begrijpt (ECB5), het opsporen van bronnen ter aanvulling
van eigen resultaten (ECB3) en het kunnen werken in groepsverband
(ECB2) .
De Bachelorproef heeft als leerdoel:
-
het begrijpen en situeren
van de actuele ontwikkelingen in de methodologie, analytische
technieken en gegevensanalyse
voor
het brede spectrum van het biologisch onderzoek.
-
het toepassen
van methoden en technieken d.m.v. een stage in een onderzoekslabo
m.i.v. rapportage
-
de capaciteit ontwikkelen tot correcte
en kritische interpretatie van biologische en ecologische
aspecten in de maatschappij
(beleid, industrie en onderzoek)
-
het verkrijgen van inzicht
in de concepten, vraagstellingen en experimentele benaderingen
in de biologie, m.i.v.
bio-ethiek en filosofie.
Inhoud
De
praktische invulling gebeurt in samenspraak met de promotor
van de Bachelorproef. De promotor begeleidt een origineel
gedeelte van onderzoek en/of analyse in het labo en/of terrein.
Vooral met het oog op het wetenschappelijk rapport zijn de
studenten verondersteld, zelf een grondige literatuurstudie
rond een topic uit te voeren.
Verwachte resultaten
De Bachelorproef wordt ingediend en gepresenteerd onder de
vorm van een wetenschappelijk rapport (manuscript
formaat volgens een internationaal tijdschrift) en onder de
vorm van een poster (+ mondelinge verdediging).
Je zal alle detailles hier vinden: "Voorstelling
van resultaten van de Bachelorproef ".
Link naar onze richtlijnen
over het schrijven van een Bachelorproef
Thema's bachelorproef
Dit zijn voorbeelden, de thema’s worden natuurlijk bediscussieerd met de studenten en aangepast aan de actuele stand van zaken van het onderzoeksdomein.
LABORATORIUM VOOR ALGEMENE PLANTKUNDE EN NATUURBEHEER
Experimenteel opvolgen van de gene flow en bestuiversbewegingen
in gefragmenteerde populaties van sleutelbloemen (terreinwerk,
fluorescente pollen-analogen, bestuiverspatronen)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Anja Van Geert , Iris Stiers (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html : Conservation
genetics, Primula
Hybridisatie en introgressie in rivierbegeleidende
wilgensoorten (terreinwerk, microsatellietDNA,
groeiexperimenten)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html : Conservation
genetics,Willows
Fylogeografische dispersie patronen van submerse
waterplanten (microsatelliet en chloroplastDNA
variatie)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html : Conservation
genetics, Aquatic plants
Alternatieve ecologische evenwichten
in heldere en troebele vijvers van het Brussels
Gewest (terreinwerk,
fytoplankton, zooplankton, chlorofyl en nutriënten)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Anatoly Peretyatko (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html: Limnology,
Ponds
Competitie experimenten met hoog invasieve waterplanten
(design, aquariumproeven, groei en biomassa)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Iris Stiers (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html: Limnology,
Ponds
Monitoring van ecologische waterkwaliteit
op basis van diatomeeën (terreinwerk, kiezelalgen
en nutriënten)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Theresia Ndum Foy (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html: Limnology,
Rivers
Het watertransportsysteem van de mangrove Avicennia
marina: ecologische plasticiteit of veilig compromis?
Promotor : Prof. Dr. Nico Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be
Groeiringanalyse van de mangrove Bruguiera gymnorrhiza
of Ceriops tagal of Heritiera littoralis of Xylocarpus
granatum of Lumnitzera racemosa.
Vogeltrek en ruimtelijke ordening : hoe de geschiktheid
van de ligging van gebieden als pleisterplaatsen
voor trekvogels te bepalen ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be
Hoe klimaatgegevens koppelen aan mangrovedynamiek
?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be
Mangrovedegradatie : hoe vastte stellen dat mangrove
achteruitgaat en hoe de (historische) menselijke
rol hierin te bepalen ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be
Visuele analyse van luchtfoto's en satellietbeelden
: een krachtige aanpak, maar hoe de subjectiviteit
van de waarnemer(s) verminderen ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be
LABORATORIUM VOOR CELLULAIRE
GENETICA
URL : http://we.vub.ac.be/~cege/
Invloed van XPD genetische polymorfismen op DNA repair fenotype
van polycyclische aromatische koolwaterstoffen (BPDE)
Promotor: Prof. Dr. Micheline Volders (CEGE) mkirschv@vub.ac.be
Contact persoon: lic. Kim Van de Loock, Vakgroep
Biologie, VUB Kim.Vande.Loock@vub.ac.be
Zijn kinderen meer of minder gevoelig voor mutagenen
dan volwassenen?
Promotor: Prof. Dr. Micheline Volders (CEGE) mkirschv@vub.ac.be
Contact persoon: Dr. Ilse Decordier, Vakgroep Biologie,
VUB idecordi@vub.ac.be
Cloning, sequencing and analysis of genomic region
of the HOX complex of amphibians
Promotor : Prof. Dr. Luc Leyns (CEGE) lleyns@vub.ac.be
supervisor: Denis Piette – 7F430b
http://we.vub.ac.be/~cege/leyns/evo_devo.html
Neural differentiation and patterning of embryonic
stem cells as assessed by real-time PCR
Promotor : Prof. Dr. Luc Leyns (CEGE) lleyns@vub.ac.be
supervisor: Marijke Hendricks –7F430b
http://we.vub.ac.be/~cege/leyns/stem_cells.html
Activity of secreted factors (e.g. Wnts) on the
differentiation status of brain cancer stem cells..
Promotor : Prof. Dr. Luc Leyns (CEGE) lleyns@vub.ac.be
supervisor: Hoang Van Xong – 7F424b
http://we.vub.ac.be/~cege/leyns/cancer.html
Evaluatie van de compatibiliteit van het commercieel
preparaat Serenade (Bacillus subtilis) met hommels
als vliegende dokters.
Promotor: Prof. Dr. ir. Guy Smagghe, (CEGE) guy.smagghe@vub.ac.be
Contact personen : lic. Veerle Mommaerts, vakgroep
Biologie, VUB, veerle.mommaerts@vub.ac.be
Studie naar de aanwezigheid van chemosensorische
eiwitten (CSPs) bij bestuivende insecten
Promotor: Prof. Dr. ir. Guy Smagghe, (CEGE) guy.smagghe@vub.ac.be
Contact personen : lic. Veerle Mommaerts, vakgroep
Biologie, VUB, veerle.mommaerts@vub.ac.be
LABORATORIUM VOOR GENETISCHE
VIROLOGIE
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens (GEVI) jphernal@vub.ac.be
Begeleiding : J.-P. Hernalsteens, V. Derous,
Z. Li & F. Deboeck
Evaluatie van de nematode Caenorhabditis elegans
als surrogaat gastheer voor uropathogene Escherichia
coli
(Optimaliseren en interpreteren van infectieproeven
met wild type en mutante bacteriestammen)
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens
(GEVI) jphernal@vub.ac.be
Contactpersoon: J.-P. Hernalsteens (jphernal@vub.ac.be)
Referentie: Sifri CD, Begun J, Ausubel FM. The
worm has turned--microbial virulence modeled
in Caenorhabditis elegans. Trends Microbiol.
2005; 13:119-27.
Transposonmutagenese van uropathogene Escherichia
coli en identificatie van genen betrokken bij
de biofilmvorming
(Insertiemutagenese, testen van biofilm vorming,
identificatie van de betrokken genen door PCR
en sequentieanalyse)
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens
(GEVI) jphernal@vub.ac.be
Contactpersoon: J.-P. Hernalsteens (jphernal@vub.ac.be)
Evaluatie van genetische methoden voor de identificatie
van bacteriofaagreceptoren
(Insertiemutagenese, selectie van resistente
mutanten, identificatie van de betrokken genen
door PCR en sequentieanalyse)
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens
(GEVI) jphernal@vub.ac.be
Contactpersoon: J.-P. Hernalsteens (jphernal@vub.ac.be)
LABORATORIUM VOOR ECOLOGIE EN SYSTEMATIEK
Evolutie: Identificatie van nieuwe kikker soorten
met DNA-barcoding
Promotor en contact : Franky Bossuyt, ECOL,
fbossuyt@vub.ac.be
Referentie: http://www.amphibia.be/
Ethologie: Op zoek naar sex-feromonen in kikkers
Promotor en contact : Franky Bossuyt, ECOL,
fbossuyt@vub.ac.be
Referentie: http://www.amphibia.be/
LABORATORIUM VOOR ANTROPOGENETICA
Vergelijkende studie van 4 mathematische modellen
voor het beschrijven van het menselijk groeipatroon
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie,
DIER, rhauspie@vub.ac.be
Studie van de individuele groeipatronen voor
verschillende lichaamsdimensies door middel van
modelisatie
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie,
DIER, rhauspie@vub.ac.be
Adiposity rebound
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie,
DIER, rhauspie@vub.ac.be
Schatten van de positie op de BMI referentiecurve
op basis van lengte en gewicht
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie,
DIER, rhauspie@vub.ac.be
UIT BIO-INGENIEUR VAKGROEP:
ERFELIJKHEID EN MICROBIOLOGIE
Promotor : Prof. Dr. Daniël Charlier (MICR)
dcharlie@vub.ac.be
Moleculaire mechanismen van genexpressie bij
Archaea: Lrp-achtige transcriptieregulators (Leucine-responsive
regulatory protein) van Sulfolobus solfataricus,
een hyperthermoacidofiel archaeon.
Promotor en contact: Prof. Dr. Daniël Charlier
(MICR), dcharlie@vub.ac.be
of Dr. Ir. Eveline Peeters (MICR), espeeter@vub.ac.be
Referentie: http://imol.vub.ac.be (klikken op
Research Topics, dan op Microbiology, dan op
Transcriptional regulation in Bacteria and Archaea).
Regulatie van het arginine en pyrimidine metabolisme
bij het modelorganisme Escherichia coli.
Promotor en contact: Prof. Dr. Daniël Charlier
(MICR), dcharlie@vub.ac.be
Referentie: http://imol.vub.ac.be (klikken op
Research Topics, dan op Microbiology, dan op
Transcriptional regulation in Bacteria and Archaea).
MICROBIELE INTERACTIES
Promotor : Prof. Dr. Pierre Cornelis (MINT) pcornel@vub.ac.be
De groep focusseert zich op de studie van een
groep van Gram-negatieve bacteriën, de Pseudomonas.
De verschillende species van deze groep zijn
alomtegenwoordig en kunnen in zeer diverse ecologische
niches vertoeven dankzij hun enorme metabolische
diversiteit. P. fluorescens, P. putida en nog
slecht gedefinieerde species kunnen gemakkelijk
uit de rizosfeer van planten geïsoleerd
en geïdentificeerd worden. Ze produceren
het geel groene pigment pyoverdine die ook een
siderofoor is, met een hoog affiniteit voor ijzer.
Deze bacteriën produceren ook secundaire
sideroforen, soms met antifungaal of antibacteriële
activiteit. Een laatst kenmerk van de pseudomonaden
is de productie van andere secundaire metabolieten
met biologische activiteit.
De geïnteresseerde studenten kunnen één
of verschillende van de volgende experimenten
combineren: