Bachelorproef

Opleidingsonderdeelfiche: Bachelorproef

Lijst van thema's Bachelorproef

Voorstelling van resultaten van de Bachelorproef

Richtlijnen over het schrijven van een Bachelorproef

Leerdoelen

 

De competenties, gekoppeld aan de Bachelorproef, zijn het kunnen plannen en uitvoeren van het manipulatie-gedeelte van onderzoek (ECB8) , het kunnen begrijpen en beoordelen van onderzoeksresultaten (ECB7), het in staat zijn een biologische vraagstelling te formuleren (ECB6), het overbrengen van datgene wat de student ontwikkelt en begrijpt (ECB5), het opsporen van bronnen ter aanvulling van eigen resultaten (ECB3) en het kunnen werken in groepsverband (ECB2) .

 

De Bachelorproef heeft als leerdoel:

  • het begrijpen en situeren van de actuele ontwikkelingen in de methodologie, analytische technieken en gegevensanalyse voor het brede spectrum van het biologisch onderzoek.
  • het toepassen van methoden en technieken d.m.v. een stage in een onderzoekslabo m.i.v. rapportage
  • de capaciteit ontwikkelen tot correcte en kritische interpretatie van biologische en ecologische aspecten in de maatschappij (beleid, industrie en onderzoek)
  • het verkrijgen van inzicht in de concepten, vraagstellingen en experimentele benaderingen in de biologie, m.i.v. bio-ethiek en filosofie.

 

Inhoud

De praktische invulling gebeurt in samenspraak met de promotor van de Bachelorproef. De promotor begeleidt een origineel gedeelte van onderzoek en/of analyse in het labo en/of terrein. Vooral met het oog op het wetenschappelijk rapport zijn de studenten verondersteld, zelf een grondige literatuurstudie rond een topic uit te voeren.

 


 

Verwachte resultaten

De Bachelorproef wordt ingediend en gepresenteerd onder de vorm van een wetenschappelijk rapport (manuscript formaat volgens een internationaal tijdschrift) en onder de vorm van een poster (+ mondelinge verdediging).

Je zal alle detailles hier vinden: "Voorstelling van resultaten van de Bachelorproef ".

Link naar onze richtlijnen over het schrijven van een Bachelorproef

Thema's bachelorproef

Dit zijn voorbeelden, de thema’s worden natuurlijk bediscussieerd met de studenten en aangepast aan de actuele stand van zaken van het onderzoeksdomein.

 

LABORATORIUM VOOR ALGEMENE PLANTKUNDE EN NATUURBEHEER

Experimenteel opvolgen van de gene flow en bestuiversbewegingen in gefragmenteerde populaties van sleutelbloemen (terreinwerk, fluorescente pollen-analogen, bestuiverspatronen)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Anja Van Geert , Iris Stiers (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html : Conservation genetics, Primula

Hybridisatie en introgressie in rivierbegeleidende wilgensoorten (terreinwerk, microsatellietDNA, groeiexperimenten)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html : Conservation genetics,Willows

Fylogeografische dispersie patronen van submerse waterplanten (microsatelliet en chloroplastDNA variatie)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html : Conservation genetics, Aquatic plants

Alternatieve ecologische evenwichten in heldere en troebele vijvers van het Brussels Gewest (terreinwerk, fytoplankton, zooplankton, chlorofyl en nutriënten)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Anatoly Peretyatko (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html: Limnology, Ponds

Competitie experimenten met hoog invasieve waterplanten (design, aquariumproeven, groei en biomassa)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Iris Stiers (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html: Limnology, Ponds

Monitoring van ecologische waterkwaliteit op basis van diatomeeën (terreinwerk, kiezelalgen en nutriënten)
Promotor : Prof. Dr. Ludwig Triest (APNA) ltriest@vub.ac.be
Contact Theresia Ndum Foy (APNA)
http://www.vub.ac.be/APNA/frameset.html: Limnology, Rivers

Het watertransportsysteem van de mangrove Avicennia marina: ecologische plasticiteit of veilig compromis?
Promotor : Prof. Dr. Nico Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be

Groeiringanalyse van de mangrove Bruguiera gymnorrhiza of Ceriops tagal of Heritiera littoralis of Xylocarpus granatum of Lumnitzera racemosa.

Vogeltrek en ruimtelijke ordening : hoe de geschiktheid van de ligging van gebieden als pleisterplaatsen voor trekvogels te bepalen ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be

Hoe klimaatgegevens koppelen aan mangrovedynamiek ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be

Mangrovedegradatie : hoe vastte stellen dat mangrove achteruitgaat en hoe de (historische) menselijke rol hierin te bepalen ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be

Visuele analyse van luchtfoto's en satellietbeelden : een krachtige aanpak, maar hoe de subjectiviteit van de waarnemer(s) verminderen ?
Promotor : Prof. Dr. N. Koedam (APNA), nikoedam@vub.ac.be


LABORATORIUM VOOR CELLULAIRE GENETICA

URL : http://we.vub.ac.be/~cege/

Invloed van XPD genetische polymorfismen op DNA repair fenotype van polycyclische aromatische koolwaterstoffen (BPDE)
Promotor: Prof. Dr. Micheline Volders (CEGE) mkirschv@vub.ac.be
Contact persoon: lic. Kim Van de Loock, Vakgroep Biologie, VUB Kim.Vande.Loock@vub.ac.be

Zijn kinderen meer of minder gevoelig voor mutagenen dan volwassenen?
Promotor: Prof. Dr. Micheline Volders (CEGE) mkirschv@vub.ac.be
Contact persoon: Dr. Ilse Decordier, Vakgroep Biologie, VUB idecordi@vub.ac.be

Cloning, sequencing and analysis of genomic region of the HOX complex of amphibians
Promotor : Prof. Dr. Luc Leyns (CEGE) lleyns@vub.ac.be
supervisor: Denis Piette – 7F430b
http://we.vub.ac.be/~cege/leyns/evo_devo.html

Neural differentiation and patterning of embryonic stem cells as assessed by real-time PCR

Promotor : Prof. Dr. Luc Leyns (CEGE) lleyns@vub.ac.be
supervisor: Marijke Hendricks –7F430b
http://we.vub.ac.be/~cege/leyns/stem_cells.html

Activity of secreted factors (e.g. Wnts) on the differentiation status of brain cancer stem cells..
Promotor : Prof. Dr. Luc Leyns (CEGE) lleyns@vub.ac.be
supervisor: Hoang Van Xong – 7F424b
http://we.vub.ac.be/~cege/leyns/cancer.html

Evaluatie van de compatibiliteit van het commercieel preparaat Serenade (Bacillus subtilis) met hommels als vliegende dokters.
Promotor: Prof. Dr. ir. Guy Smagghe, (CEGE) guy.smagghe@vub.ac.be
Contact personen : lic. Veerle Mommaerts, vakgroep Biologie, VUB, veerle.mommaerts@vub.ac.be

Studie naar de aanwezigheid van chemosensorische eiwitten (CSPs) bij bestuivende insecten
Promotor: Prof. Dr. ir. Guy Smagghe, (CEGE) guy.smagghe@vub.ac.be
Contact personen : lic. Veerle Mommaerts, vakgroep Biologie, VUB, veerle.mommaerts@vub.ac.be


LABORATORIUM VOOR GENETISCHE VIROLOGIE

Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens (GEVI) jphernal@vub.ac.be
Begeleiding : J.-P. Hernalsteens, V. Derous, Z. Li & F. Deboeck

Evaluatie van de nematode Caenorhabditis elegans als surrogaat gastheer voor uropathogene Escherichia coli
(Optimaliseren en interpreteren van infectieproeven met wild type en mutante bacteriestammen)
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens (GEVI) jphernal@vub.ac.be
Contactpersoon: J.-P. Hernalsteens (jphernal@vub.ac.be)
Referentie: Sifri CD, Begun J, Ausubel FM. The worm has turned--microbial virulence modeled in Caenorhabditis elegans. Trends Microbiol. 2005; 13:119-27.

Transposonmutagenese van uropathogene Escherichia coli en identificatie van genen betrokken bij de biofilmvorming
(Insertiemutagenese, testen van biofilm vorming, identificatie van de betrokken genen door PCR en sequentieanalyse)
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens (GEVI) jphernal@vub.ac.be
Contactpersoon: J.-P. Hernalsteens (jphernal@vub.ac.be)

Evaluatie van genetische methoden voor de identificatie van bacteriofaagreceptoren
(Insertiemutagenese, selectie van resistente mutanten, identificatie van de betrokken genen door PCR en sequentieanalyse)
Promotor : Prof. Dr. Jean-Pierre Hernalsteens (GEVI) jphernal@vub.ac.be
Contactpersoon: J.-P. Hernalsteens (jphernal@vub.ac.be)


LABORATORIUM VOOR ECOLOGIE EN SYSTEMATIEK

Evolutie: Identificatie van nieuwe kikker soorten met DNA-barcoding
Promotor en contact : Franky Bossuyt, ECOL, fbossuyt@vub.ac.be
Referentie: http://www.amphibia.be/

Ethologie: Op zoek naar sex-feromonen in kikkers
Promotor en contact : Franky Bossuyt, ECOL, fbossuyt@vub.ac.be
Referentie: http://www.amphibia.be/


LABORATORIUM VOOR ANTROPOGENETICA


Vergelijkende studie van 4 mathematische modellen voor het beschrijven van het menselijk groeipatroon
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie, DIER, rhauspie@vub.ac.be

Studie van de individuele groeipatronen voor verschillende lichaamsdimensies door middel van modelisatie
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie, DIER, rhauspie@vub.ac.be

Adiposity rebound
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie, DIER, rhauspie@vub.ac.be

Schatten van de positie op de BMI referentiecurve op basis van lengte en gewicht
Promotor en contact : Prof. Dr. Roland Hauspie, DIER, rhauspie@vub.ac.be


UIT BIO-INGENIEUR VAKGROEP:


ERFELIJKHEID EN MICROBIOLOGIE

Promotor : Prof. Dr. Daniël Charlier (MICR) dcharlie@vub.ac.be

Moleculaire mechanismen van genexpressie bij Archaea: Lrp-achtige transcriptieregulators (Leucine-responsive regulatory protein) van Sulfolobus solfataricus, een hyperthermoacidofiel archaeon.
Promotor en contact: Prof. Dr. Daniël Charlier (MICR), dcharlie@vub.ac.be
of Dr. Ir. Eveline Peeters (MICR), espeeter@vub.ac.be
Referentie: http://imol.vub.ac.be (klikken op Research Topics, dan op Microbiology, dan op Transcriptional regulation in Bacteria and Archaea).

Regulatie van het arginine en pyrimidine metabolisme bij het modelorganisme Escherichia coli.
Promotor en contact: Prof. Dr. Daniël Charlier (MICR), dcharlie@vub.ac.be
Referentie: http://imol.vub.ac.be (klikken op Research Topics, dan op Microbiology, dan op Transcriptional regulation in Bacteria and Archaea).

MICROBIELE INTERACTIES

Promotor : Prof. Dr. Pierre Cornelis (MINT) pcornel@vub.ac.be

De groep focusseert zich op de studie van een groep van Gram-negatieve bacteriën, de Pseudomonas. De verschillende species van deze groep zijn alomtegenwoordig en kunnen in zeer diverse ecologische niches vertoeven dankzij hun enorme metabolische diversiteit. P. fluorescens, P. putida en nog slecht gedefinieerde species kunnen gemakkelijk uit de rizosfeer van planten geïsoleerd en geïdentificeerd worden. Ze produceren het geel groene pigment pyoverdine die ook een siderofoor is, met een hoog affiniteit voor ijzer. Deze bacteriën produceren ook secundaire sideroforen, soms met antifungaal of antibacteriële activiteit. Een laatst kenmerk van de pseudomonaden is de productie van andere secundaire metabolieten met biologische activiteit.
De geïnteresseerde studenten kunnen één of verschillende van de volgende experimenten combineren:

  • Isolatie van Pseudomonas uit grond, rizosfeer of water (eventueel gedurende huidig practicum geïsoleerde stammen).
  • Fenotypische eigenschappen (productie van sideroforen, enzymes en antifungale metabolieten)
  • Transposon metabolieten voor de aanmaak van een bank van mutanten.
  • Isolatie van mutanten defectieve voor enzym, siderofoor of secundaire metabolieten productie.
  • Identificatie van de mutatie (plaats van insertie in het genoom)
  • Complementatie van de mutant via een genomische bank (wilde-type gen cloneren)
  • Sequentie en studie van de regulatie van de betrokkene genen.


©2005• Vakgroep Biologie - VUB • Pleinlaan 2 • 1050 Elsene • Tel.: 02/629.34.05 • gguns@vub.ac.be